Si es la primera vez que actualizas, debes meterlo en la carpeta ‘comunes’ correspondiente a tu core (Trinity ó MaNGOS) sustituyendo al que hay vacío, y actualiza la DB con el instalador.

Si ya has hecho la actualización, debes subirlo manualmente a la DB mangos (para MaNGOS) ó world (si es Trinity) con el cliente MySQL que normalmente uses.